Межгенотипные рекомбинанты вируса гепатита с - природные модели для изучения молекулярно-генетических детерминант резистентности вируса к действию противовирусных препаратов
https://doi.org/10.18705/2311-4495-2014-0-3-29-38
Аннотация
В работе представлены данные об организации генома межгенотипных рекомбинантов вируса гепатита С, описаны отличительные особенности генетических детерминант, потенциально вовлеченных в формирование резистентности к действию интерферона, обобщены результаты лечения пациентов, инфицированных рекомбинантными формами вируса гепатита С.
Об авторах
Ольга Викторовна Калинина
ФБУН «Санкт-Петербургский научно-исследовательский институт эпидемиологии и микробиологии им. Пастера» Роспотребнадзора
Россия
Россия
Кристина Рубеновна Дудина
ГБОУ ВПО «Московский государственный медико-стоматологический университет им. А.И. Евдокимова» Минздрава России
Россия
Россия
Анастасия Николаевна Козина
ГБОУ ВПО «Московский государственный медико-стоматологический университет им. А.И. Евдокимова» Минздрава России
Россия
Россия
Александр Валентинович Дмитриев
ФГБУ «Научно-исследовательский институт экспериментальной медицины» СЗО РАМН
Россия
Россия
Мария Георгиевна Исагулянц
ФГБУ «Научно-исследовательский институт вирусологии им. Д.И. Ивановского» Минздрава России
Россия
Россия
Ольга Олеговна Знойко
ГБОУ ВПО «Московский государственный медико-стоматологический университет им. А.И. Евдокимова» Минздрава России
Россия
Россия
Список литературы
1. Choo Q.L., Richman K.H., Han J.H. et al. Genetic organization and diversity of the hepatitis C virus // Proc. Natl. Acad. Ssi. USA. - 1991. - Vol. 88, № 6. - P. 2451-2455.
2. Lindenbach B.D., Rice C.M. Unrevalling hepatitis C virus replication from genome to function // Nature. - 2005. - Vol. 436, № 7053. - P. 933-938.
3. World Health Organization. Hepatitis C. Fact sheet. - 2012. - № 164. / [Электронный ресурс]. URL: http://www.who.int/mediacentre/factsheets/fs164/en/
4. Вирусные гепатиты в Российской Федерации / под ред. Онищенко Г.Г., Жебруна А.Б. - СПб: НИИЭМ им. Пастера, 2010 - 204 с.
5. Simmonds P. Viral heterogeneity of the hepatitis C virus // J. Hepatol. - 1999. - Vol. 31, Suppl. 1. - P. 54-60.
6. Kalinina O., Norder H., Mukomolov S., Magnius L.O. A natural intergenotypic recombinant of hepatitis C virus identified in St. Petersburg // J. Virol. - 2002. - Vol. 76, № 8. - P. 4034-4043.
7. Kalinina O., Norder H., Magnius L.O. Full-Length Open Reading Frame of a Recombinant hepatitis C Virus Strain from St. Petersburg: Proposed mechanism for its formation // J. Gen. Virol. - 2004. - Vol. 85, № 7. - P. 1853-1857.
8. Smith D.B., Bukh J., Kuiken C. et al. Expanded classification of hepatitis C virus into 7 genotypes and 67 subtypes : updated criteria and genotype assignment WEB resource // Hepatology. - 2014. - Vol. 59, № 1. - P. 318-327.
9. Ющук Н.Д., Климова Е.А., Знойко О.О. и др. Протокол диагностики и лечения больных вирусными гепатитами В и С // Росс. Журнал. Гас. Гепат. Колопрокт. - 2010. - Vol. 20, № 6. - С. 4-60.
10. Bhattacharya D., Accola M.A., Ansari I.H. et al. Naturally occurring genotype 2b/1a hepatitis C virus in the United States // Virol. J. - 2011. - Vol. 8, № 458. / [Электронный ресурс]. doi:10.1186/1743-422X-8-458
11. Lee Y.M., Lin H.J., Chen Y.J. et al. Molecular epidemiology of HCV genotypes among injection drug users in Taiwan: Full-length sequences of two new subtype 6w strains and a recombinant form_2b/6w // J. Med. Virol. - 2009. - Vol. 82, № 1. - P. 57-68.
12. Legrand-Abravanel F., Claudinon J., Nicot F. et al. New natural intergenotypic (2/5) recombinant of hepatitis C virus // J. Virol. - 2007. - Vol. 81, № 8. - P. 4357-4362.
13. Noppornpanth S., Lien T.X., Poovorawan Y. et al. Identification of a Naturally Occurring Recombinant Genotype 2/6 Hepatitis C Virus // J. Virol. - 2006. - Vol. 80, № 15. - P. 7569-7577.
14. Kageyama S., Agdamag D.M., Alesna E.T. et al. A natural inter-genotypic (2b/1b) recombinant of hepatitis C virus in the Philippines // J. Med. Virol. - 2006. - Vol. 78, № 11. - P. 1423-1428.
15. Yokoyama K., Takahashi M., Nishizawa T. et al. Identification and characterization of a natural inter-genotypic (2b/1b) recombinant hepatitis C virus in Japan // Arch. Virol. J. - 2011. - Vol. 156. - P. 1591-1601.
16. Hoshino H., Hino K., Miyakawa H., Takahashi K. Inter-genotypic recombinant hepatitis C virus strains in Japan noted by discrepancies between immunoassay and sequencing // J. Med. Virol. - 2012. - Vol. 1024. - P. 1018-1024.
17. Spahn C.M., Kieft J.S., Grassucci R.A. et al. Hepatitis C virus IRES RNA-induced changes in the conformation of the 40s ribosomal subunit // Science. - 2001. - Vol. 291, № 5510. - 1959-1962.
18. Collier A.J., Tang S., Elliott R.M. Translation efficiencies of the 5’ untranslated region from representatives of the six major genotypes of hepatitis C virus using a novel bicistronic reporter assay system // J. Gen. Virol. - 1998. Vol. 79, № 10. - P. 2359-2366.
19. Kolykhalov A.A., Mihalik K., Feinstone S.M., Rice C.M. Hepatitis C virus-encoded enzymatic activities and conserved RNA elements in the 3’ nontranslated region are essential for virus replication in vivo // J. Virol. - 2000. - Vol. 74, № 4. - P. 2046-2051.
20. Lu W., Lo S.Y., Chen M. et al. Activation of p53 tumor suppressor by hepatitis C virus core protein // Virology. - 1999. - Vol. 264, № 1. - P. 134-141.
21. Yoshida T., Hanada T., Tokuhisa T. et al. Activation of STAT3 by the hepatitis C virus core protein leads to cellular transformation // J. Exp. Med. - 2002. - Vol. 196, № 5. - P. 641-653.
22. Tsutsumi T., Suzuki T., Moriya K. et al. Hepatitis C virus core protein activates ERK and p38 MAPK in cooperation with ethanol in transgenic mice // Hepatology. - 2003. - Vol. 38, № 4. - P. 820-828.
23. Roohvand F., Maillard P., Lavergne J.P. et al. Initiation of hepatitis C virus infection requires the dynamic microtubule network: role of the viral nucleocapsid protein // J. Biol. Chem. - 2009. - Vol. 284, № 20. - P. 13778-13791.
24. Miyanari Y., Atsuzawa K., Usuda N. et al. The lipid droplet is an important organelle for hepatitis C virus production // Nat. Cell Biol. - 2007. - Vol. 9, № 9. - P. 1089-1097.
25. Miyoshi H., Fujie H., Shintani Y. et al. Hepatitis C virus core protein exerts an inhibitory effect on suppressor of cytokine signaling (SOCS)-1 gene expression // J. Hepatol. - 2005. - Vol. 43, № 5. - P. 757-763.
26. Vassilaki N., Mavromara P. Two alternative translation mechanisms are responsible for the expression of the HCV ARFP/F/core+1 coding open reading frame // J. Biol. Chem. - 2003. - Vol. 278, № 42. - P. 40503-40513.
27. Dalagiorgou G., Vassilaki N., Foka P. et al. High levels of HCV core+1 antibodies in HCV patients with hepatocellular carcinoma // J. Gen. Virol. - 2011. - Vol. 92, № 6. - P. 1343-1351.
28. Cormier E., Durso R.J., Tsamis F. et al. L-SIGN (CD209L) and DC-SIGN (CD209) mediate transinfection of liver cells by hepatitis C virus // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. - 2004. - Vol. 101, № 39. - P. 14067-14072.
29. Evans M.J., von Hahn T., Tscherne D.M. et al. Claudin-1 is a hepatitis C virus co-receptor required for a late step in entry // Nature. - 2007. - Vol. 446, № 7137. - P. 801-805.
30. Ploss A., Evans M.J., Gaysinskaya VA. et al. Human occludin is a hepatitis C virus entry factor required for infection of mouse cells // Nature. - 2009. - Vol. 457, № 7231. - P. 882-886.
31. Pileri P., Uematsu Y., Campagnoli S. et al. Binding of hepatitis C virus to CD81 // Science. - 1998. - Vol. 282, № 5390. - P. 938-941.
32. Heo T.H., Lee S.M., Bartosch B. et al. Hepatitis C virus E2 links soluble human CD81 and SR-B1 protein // Virus Res. - 2006. - Vol. 121, № 1. - P. 58-64.
33. Taylor D.R., Shi S.T., Romano P.R. et al. Inhibition of the interferon-inducible protein kinase PKR by HCV E2 protein // Science. - 1999. - Vol. 285, № 5424. - P. 107-110.
34. Steinmann E., Pietschmann T. Hepatitis C virus p7-a viroporin crucial for virus assembly and an emerging target for antiviral therapy // Viruses. - 2010. - Vol. 2, № 9. - P. 2078-2095.
35. Yi M., Ma Y., Yates J., Lemon S.M. Compensatory mutations in E1, p7, NS2, and NS3 enhance yields of cell culture-infectious intergenotypic chimeric hepatitis C virus // J. Virol. - 2007. - Vol. 81, № 2. - P. 629-638.
36. Moradpour D., Penin F., Rice C.M. Replication of hepatitis C virus // Nat. Rev. Microbiol. - 2007. - Vol. 5, № 6. - P. 453-463.
37. Meylan E., Curran J., Hofmann K. et al. Cardif is an adaptor protein in the RIG-I antiviral pathway and is targeted by hepatitis C virus // Nature. - 2005. - Vol. 437, № 7062. - P. 1167-1172.
38. Li Y., Zhang Q., Liu Y. et al. Hepatitis C virus activates Bcl-2 and MMP-2 expression through multiple cellular signaling pathways // J. Virol. - 2012. - Vol. 86, № 23. - P. 12531-12543.
39. Nitta S., Sakamoto N., Nakagawa M. et al. Hepatitis C virus NS4B protein targets STING and abrogates RIGI-mediated type-I interferon-dependent innate immunity // Hepatology. - 2013. - Vol. 57, № 1. - P. 46-58.
40. Gale M.Jr., Blakely C.M., Kwieciszewski B. et al. Control of PKR proteinkinase by hepatitis C virus non-structural 5A protein: molecular mechanisms of kinase regulation // Mol. Cell Biol. - 1998. - Vol. 18, № 9. - P. 5208-5218.
41. Enomoto N., Sakuma I., Asahina Y. et al. Mutations in the nonstructural protein 5A gene and response to interferon in patients with chronic hepatitis C virus 1b infection // New Eng. J. Med. - 1996. - Vol. 334, № 2. - P. 77-81.
42. Kumthip K., Pantip C., Chusri P. et al. Correlation between mutations in the core and NS5A genes of hepatitis C virus genotypes 1a, 1b, 3a, 3b, 6f and the response to pegylated interferon and ribavirin combination therapy // J. Viral. Hepat. - 2011. - Vol. 18, № 4. - P. 117-125.
43. Bouzgarrou N., Hassen E., Mahfoudh W. et al. NS5A (ISDR-V3) region genetic variability of Tunisian HCV-1b strains: Correlation with the response to the combined interferon/ribavirin therapy // J. Med. Virol. - 2009. - Vol. 81, № 12. - P. 2021-2028.
44. Bressanelli S., Tomei L., Roussel A. et al. Crystal structure of the RNA-dependent RNA polymerase of hepatitis C virus // PNAS. - 1999. - Vol. 96, № 23. - P. 13034-13039.
45. Luo G., Hamatake R.K., Mathis D.M. et al. De novo initiation of RNA synthesis by the RNA-dependent RNA polymerase (NS5B) of hepatitis C virus // J. Virol. - 2000. - Vol. 74, № 2. - P. 851-863.
46. Ranjith-Kumar C.T., Gutshall L., Kim M.J et al. Requirements for de novo initiation of RNA synthesis by recombinant flaviviral RNA-dependent RNA polymerases // J. Virol. - 2002. - Vol. 76, № 24. - P. 12526-12536.
47. Watashi K., Ishii N., Hijikata M. et al. Cyclophilin B is a functional regulator of hepatitis C virus RNA polymerase // Mol. Cell. - 2005. - Vol. 19, № 1. - P. 111-122.
48. Знойко О.О. Клинико-патогенетические особенности естественного течения вирусного гепатита С и оптимизация лабораторно-диагностических критериев исходов заболевания: автореф. дис.. докт. мед. наук. - М., 2007. - 44 с.
49. Morel V., Descamps V., François C. et al. Emergence of a genomic variant of the recombinant 2k/1b strain during a mixed hepatitis C infection: a case report // J. Clin. Virol. - 2010. - Vol. 47, № 4. - P. 382-386.
Рецензия
Для цитирования:
Калинина О.В., Дудина К.Р., Козина А.Н., Дмитриев А.В., Исагулянц М.Г., Знойко О.О. Межгенотипные рекомбинанты вируса гепатита с - природные модели для изучения молекулярно-генетических детерминант резистентности вируса к действию противовирусных препаратов. Трансляционная медицина. 2014;(3):29-38. https://doi.org/10.18705/2311-4495-2014-0-3-29-38
For citation:
Kalinina O.V., Dudina K.R., Kozina A.N., Dmitriev A.V., Isaguliants M.G., Znoiko O.O. HEPATITIS C VIRUS INTERGENOTYPIC RECOMBINANTS: THE NATURAL MODEL FOR STUDYING MOLECULAR GENETIC DETERMINANTS OF VIRAL RESISTANCE TO ANTIVIRAL DRUGS. Translational Medicine. 2014;(3):29-38. (In Russ.) https://doi.org/10.18705/2311-4495-2014-0-3-29-38
Просмотров:
602
Послать статью по эл. почте 