Вахрушев Юрий Алексеевич, ассистент кафедры клинической лабораторной диагностики и генетики
ул. Аккуратова, д. 2, Санкт-Петербург, 197341
Yuriy A. Vakhrushev, assistant of the Department of Clinical Laboratory Diagnostics and Genetics
Akkuratova str., 2, Saint Petersburg, 197341
Муравьев Алексей Сергеевич, лаборант-исследователь НИЛ молекулярного и клеточного моделирования и генной терапии НЦМУ «Центр персонализированной медицины», клинический ординатор кафедры детских болезней Института медицинского образования
Санкт-Петербург
Aleksey S. Muravyov, laboratory researcher at the Research Laboratory of Molecular and Cellular Modeling and Gene Therapy, World-Class Research Centre for Personalized Medicine, Clinical Resident of the Department of Children’s Diseases of the Institute of Medical Education
Saint Petersburg
Козырева Александра Анатольевна, к.б.н., старший научный сотрудник Института молекулярной биологии и генетики
Санкт-Петербург
Alexandra A. Kozyreva, Ph.D., Senior Researcher, Institute of Molecular Biology and Genetics
Saint Petersburg
Жук Сергей Владимирович, младший научный сотрудник НИЛ молекулярного и клеточного моделирования и генной терапии НЦМУ «Центр персонализированной медицины»
Санкт-Петербург
Sergey V. Zhuk, Junior Researcher, Research Laboratory for Molecular and Cellular Modeling and Gene Therapy, World-Class Research Centre for Personalized Medicine
Saint Petersburg
Ротарь Оксана Петровна, к.м.н., заведующий НИЛ эпидемиологии артериальной гипертензии
Санкт-Петербург
Oksana P. Rotar’, Ph.D., Head of the Research Laboratory for the Epidemiology of Arterial Hypertension
Saint Petersburg
Костарева Анна Александровна, д.м.н., директор Института молекулярной биологии и генетики
Санкт-Петербург
Anna A. Kostareva, Doctor of Medical Sciences, Director of the Institute of Molecular Biology and Genetics
Saint Petersburg
Актуальность. Гены белков саркомера, такие как MYBPC3, FLNC, TTN, RBM20, ассоциированы с развитием кардиомиопатий (КМП). Большое количество редких генетических вариантов затрудняет интерпретацию генетических исследований и оценку степени патогенности выявленных вариантов. Последнее осложняется отсутствием единой информационной базы с данными по частоте редких вариантов в условно здоровой российской популяции. Полиморфизмы в данных генах зачастую выступают в качестве модификаторов, отягощая клиническое течение КМП, обусловленных мутациями в других генах.
Цель. Сравнить частоту редких (менее 0,1 %) миссенс- и укорачивающих вариантов в генах TTN, FLNC, MYBPC3, RBM20 в группе пациентов с КМП и в общей популяции.
Материалы и методы. В группу КМП включен 251 пациент. В контрольную группу включены 192 мужчины (из исследования ЭССЕ-РФ). Было выполнено молекулярно-генетическое обследование при помощи технологии высокопроцессивного секвенирования с последующей верификацией выявленных генетических вариантов секвенированием по Сэнгеру.
Результаты. Частота укорачивающих вариантов в генах TTN, FLNC, MYBPC3, RBM20 в группе больных КМП составила 7,17 %, а миссенс-вариантов — 56,6 %. 1,5 % из них являлись патогенными, 10 % — вероятно патогенными, 39,5 % — вариантами неопределенной значимости, 31 % — вероятно доброкачественными и 18 % — доброкачественными. Частота укорачивающих вариантов в генах TTN, FLNC, MYBPC3, RBM20 в контрольной группе составила 0,52 %, а миссенс-вариантов — 15,1 %. 38 % из них являлись вариантами неопределенной значимости, 58,6 % — вероятно доброкачественными и 3,4 % — доброкачественными.
Заключение. Выявлена повышенная частота миссенс- и укорачивающих вариантов с частотой менее 0,1 % в генах TTN, FLNC, MYBPC3, RBM20 в группе пациентов с различными видами КМП.
Background. Sarcomere protein genes such as MYBPC3, FLNC, TTN, RBM20 are associated with cardiomyopathies (CMP). A large number of rare genetic variants complicates the interpretation genetic studies and assessing the pathogenicity. Moreover, there is a lack of an information about rare variants frequency in a healthy Russian population. Polymorphisms in these genes often act as modifiers, aggravating the clinical course of CMP caused by mutations in other genes.
Objective. To compare the frequency of rare (less than 0.1 %) missense and truncating variants in the TTN, FLNC, MYBPC3, RBM20 genes in the patients with CMP and in the general population.
Design and methods. The CMP group included 251 patients. The control group included 192 men (from the ESSE-RF study). A molecular genetic examination was performed using high-processive sequencing technology, followed by verification by Sanger sequencing.
Results. The frequency of truncating variants in the genes TTN, FLNC, MYBPC3, RBM20 in the group with CMP was 7.17 %, and missense variants — 56.6 %: 11.5 % were pathogenic/likely pathogenic, 39.5 % — variants of uncertain significance, 49 % — probably benign/benign. The frequency of truncating variants in the TTN, FLNC, MYBPC3, RBM20 genes in the control group was 0.52 %, and the frequency of missense variants was 15.1 %: 38 % were variants of uncertain significance, 62 % — probably benign/benign.
Conclusion. Frequency of missense and truncating variants with a frequency of less than 0.1 % in the TTN, FLNC, MYBPC3, RBM20 genes was increased in the group of patients with CMP.
The authors declare that there are no conflicts of interest present.